Amen.

Lors de la seconde guerre mondiale, l'officier SS Kurt Gerstein, professeur et ingénieur spécialisé dans l'hygiène, effectue diverses missions d'épuration des eaux pour les troupes allemandes. Séduits par son savoir-faire, ses supérieurs décident de l'envoyer « exterminer la vermine » dans des camps promis à une triste célébrité. Catholique convaincu, il se trouve horrifié en découvrant que le mot « parasite » n'a pas le même sens selon que l'on se trouve en haut ou en bas de la hiérarchie. Soucieux de ne pas passer pour un traître, il exécute les ordres mais essaie dans le même temps d'alerter les autorités religieuses. Celles-ci se montrant peu concernées, c'est un jeune jésuite qui va tenter de l'aider.